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DWK051 全基因組重測序

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全基因組重測序是對基因組序列已知物種的個(gè)體進(jìn)行基因組測序,并在個(gè)體或群體水平進(jìn)行差異性分析的方法培訓。

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一不合理波動、服務(wù)介紹

全基因組重測序是對基因組序列已知物種的個(gè)體進(jìn)行基因組測序,并在個(gè)體或群體水平進(jìn)行差異性分析的方法重要工具》e極拓展新的領域;谌蚪M重測序技術(shù),我們能夠快速的進(jìn)行種子資源普查篩選更優質,尋找到大量基因變異多種方式,并實(shí)現(xiàn)遺傳進(jìn)化分析及重要性狀候選基因預(yù)測。而隨著測序成本降低和已知基因組序列的物種增多技術創新,重測序已成為動(dòng)植物育種研究中為迅速有效的方法之一。

 

二資料、操作流程

提取基因組 DNA 并隨機(jī)打斷廣泛應用,電泳回收所需長度的 DNA 片段,并加上接頭進(jìn)行 Cluster制備橫向協同,后上機(jī)測序哪些領域。利用雙末端( Paired-End) 的方案對插入片段兩端進(jìn)行測序,除獲得序列信息外不斷創新,還有利于大片段結(jié)構(gòu)變異的挖掘建立和完善。

 

三、指標(biāo)評(píng)價(jià)

測序深度是評(píng)價(jià)測序量的重要指標(biāo)參與水平,測序深度的增加有利于基因組覆蓋度的上升大型,并同時(shí)減少測序的錯(cuò)誤率。在重測序個(gè)體水平采用雙末端測序明確相關要求,當(dāng)測序深度在 10X 以上時(shí)重要意義,基因組覆蓋度和測序錯(cuò)誤率控制均得以統籌發展。而在群體方面,3-5X 即可得到追求卓越。


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