長鏈非編碼RNA測(cè)序（long non-coding RNA sequencing探索，lncRNA-Seq）是一種使用特定方法降低樣本中rRNA 的豐度，對(duì)富集到的 RNA進(jìn)行文庫構(gòu)建產業，再對(duì)高通量測(cè)序儀產(chǎn)出的數(shù)據(jù)進(jìn)行信息分析的研究方法競爭力。lncRNA-Seq可一次性獲得樣本中大部分的lncRNAs信息，對(duì)lncRNAs的類別狀況、功能進(jìn)行深入分析機製性梗阻，從而快速準(zhǔn)確地獲得與特定生物學(xué)過程（例如發(fā)育、**等）相關(guān) lncRNA信息全過程。
數(shù)據(jù)分析內(nèi)容
標(biāo)準(zhǔn)分析項(xiàng)目
1) 去除接頭序列集成應用、低質(zhì)量序列，得到高質(zhì)量數(shù)據(jù)不負眾望；
2) 與核糖體數(shù)據(jù)庫比對(duì)高效流通，去除核糖體RNA（rRNA）數(shù)據(jù)
3) 轉(zhuǎn)錄本組裝；
4) 鑒定已知轉(zhuǎn)錄本（包括已知lncRNA）和新轉(zhuǎn)錄本精準調控；
5) 預(yù)測(cè)新的lncRNA功能；
6) lncRNA定量及差異分析（需至少2個(gè)樣品）；
7) lncRNA差異表達(dá)模式聚類解決；
分析項(xiàng)目
基于互補(bǔ)序列的lncRNA-mRNA互作分析形勢；
構(gòu)建重要的lncRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)圖；
網(wǎng)絡(luò)拓補(bǔ)學(xué)分析及網(wǎng)絡(luò)模塊分析科技實力；
功能富集分析；
ceRNA預(yù)測(cè)分析重要的作用；
樣品要求
1.樣品類型：細(xì)胞、新鮮組織或RNA樣品規模最大。
2.樣品量：細(xì)胞樣品請(qǐng)?zhí)峁┲辽?×107個(gè)細(xì)胞穩中求進，組織樣品請(qǐng)?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片，RNA樣品請(qǐng)?zhí)峁?0 μg以上的總RNA最深厚的底氣。
3.樣品質(zhì)量：RNA無明顯降解協同控製，提取的總RNA OD260/280值在1.8~2.2之間，濃度≥ 500 ng/μl品質，28S:18S ≥ 1.5重要作用，RIN ≥7。
4.樣品保存：細(xì)胞樣品或新鮮組織塊（切成~50mg的小塊）可用TRIZOL或RNA保護(hù)劑處理或液氮凍存后最為顯著，-80℃保存尤為突出。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中，-80℃保存自行開發。樣品保存期間避免反復(fù)凍融進行部署。
5.樣品運(yùn)輸：樣品置于1.5 ml管中，封口膜封好應用情況，干冰運(yùn)輸保護好。
