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dwk050 miRNA測序

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利用測序分析軟件新產品,通過小RNA測序可以快速鑒定物種全譜的小RNA組去完善,并預測新的miRNA,同時可對miRNA的靶基因進行預測和功能分析長遠所需。

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一求索、服務介紹

microRNA(miRNA)是一種大小約21—23個堿基的單鏈小分子RNA,是由具有發(fā)夾結構的約70-90個堿基大小的單鏈RNA前體經(jīng)過Dicer酶加工后生成規模,不同于siRNA(雙鏈)但是和siRNA密切相關穩定發展。microRNA通過和靶基因mRNA堿基配對引導沉默復合體(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的翻譯,從而在轉錄后水平調(diào)控蛋白表達(新發(fā)現(xiàn)miRNA也能在轉錄水平調(diào)控基因表達)聯動。miRNA在物種進化中相當保守增持能力,在動物、植物和**等中發(fā)現(xiàn)的miRNA表達均有嚴格的組織特異性和時序性行業內卷。miRNA在細胞生長和發(fā)育過程中起多種作用追求卓越,包括調(diào)控發(fā)育、分化、凋亡和增殖等合理需求。

目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR是目前主流、生物芯片技術以及第二代測序技術「哔|量;诘诙鷾y序技術的miRNA測序充分發揮,可以一次獲得數(shù)百萬條miRNA序列,能夠快速鑒定出不同組織機構、不同發(fā)育階段的特性、不同**狀態(tài)下已知和未知的miRNA及其表達差異,為研究miRNA對細胞進程的作用及其生物學影響提供了有力工具基礎。

 

二提供堅實支撐、分析項目

標準分析項目

1) 原始數(shù)據(jù)質(zhì)控(去接頭污染,去低質(zhì)量reads)高產,數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計信息化技術;

2) 與參考序列比對;

3) 小RNA與rRNA良好、tRNA逐步顯現、snRNA、snoRNA顯著、piRNA的比對信息快速增長;

4) 小RNA與miRBase 中范圍的已知的 miRNA的比對;

5) 按照優(yōu)先級將小RNA進行分類注釋占;

6) 預測新的miRNA高質量;

7) 差異miRNA分析;

8) 差異miRNA表達聚類分析激發創作;

9) miRNA靶基因預測分析

10) 靶基因功能富集分析

 

上等分析項目(以下分析選擇分析結果較好的3~5個)

靶基因蛋白互作網(wǎng)絡分析

miRNA功能協(xié)同網(wǎng)絡分析

miRNA通路協(xié)同網(wǎng)絡分析

miRNA共調(diào)控網(wǎng)絡分析

miRNA活性分析

按照客戶要求對興趣miRNA進行深入分析前景;

重要miRNA的功能富集分析;

 

三增幅最大、樣本要求

RNA樣品總量: ≥3μg

RNA樣品濃度: ≥200 ng/μL

 

四共享應用、項目周期

45個工作日


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