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LCMS-IT-TOF液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀

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LCMS-IT-TOF是一款新型質(zhì)譜儀知識和技能,它結(jié)合了QIT(離子阱)和TOF(飛行時(shí)間)技術(shù)

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LCMS-IT-TOF是一款新型質(zhì)譜儀,它結(jié)合了QIT(離子阱)和TOF(飛行時(shí)間)技術(shù)新模式。QIT和TOF相結(jié)合時(shí)實現,的技術(shù)挑戰(zhàn)是有效引入離子至QIT內(nèi),同時(shí)噴射捕獲離子到TOF組織了。這里服務體系,我們介紹新開發(fā)的技術(shù),用來解決這些問題搶抓機遇。

源設(shè)計(jì)分析,來自于島津制作所的成功的單四極質(zhì)譜儀源設(shè)計(jì),脫溶劑毛細(xì)管全面闡釋,減少碰撞離子聚焦的Q-Array非常激烈。八極桿離子透鏡可以通過CII(壓縮離子導(dǎo)入)方法有效地從LC引進(jìn)洗脫離子。離子阱QIT通過們新的清潔技術(shù)引人註目,獲得高效的MSn 能力領域。此外,BIE(彈道離子提忍剿鲃撔?。┘夹g(shù)帶來全新智能,為所有MS 實現了超越,MSn ...模式提供高分辨率。飛行管的溫度控制確保了穩(wěn)定的離子飛行路徑長(zhǎng)度和離子加速電壓去完善,從而確保質(zhì)量數(shù)穩(wěn)定橋梁作用。雙級(jí)反射,以優(yōu)化的能量吸收和時(shí)間收斂給出了出色的分辨率

LCMS-IT-TOF

LCMS-IT-TOF旨在通過使用高速/高精確度MSn(n≥10)數(shù)據(jù)在研發(fā)領(lǐng)域求索,如雜質(zhì)分析讓人糾結、代謝輪廓和生物標(biāo)記物研究,大力協(xié)助鑒定目標(biāo)化合物的新技術(shù)穩定發展。

LCMS-IT-TOF

上述數(shù)據(jù)表明四個(gè)化合物在2.0分鐘內(nèi)的分析基石之一。MSn 的自動(dòng)功能,使得它有可能獲得通過外部標(biāo)準(zhǔn)的高精確度的MSn 數(shù)據(jù)服務品質,利用高速質(zhì)譜測(cè)量性能的發生。

高速正負(fù)極性切換,在不能判斷樣品是否將作為正離子或負(fù)離子檢測(cè)時(shí)影響,它特別有用新的動力。 LCMS-IT-TOF采用了新開發(fā)的、高度精確和穩(wěn)定的電源供應(yīng)器發展契機,以及新開發(fā)的高壓開關(guān)廣泛關註,允許只有1秒或更少的極性切換(需要尖銳的色譜峰與改進(jìn)的高速色譜法)。極性切換的速率為2.5赫茲發力,它允許獲得每秒2.5倍的正離子和負(fù)離子的質(zhì)譜對(duì)優勢領先。

LCMS-IT-TOF

示例數(shù)據(jù)

LCMS-IT-TOF

LCMS-IT-TOF

LCMS-IT-TOF的離子光學(xué)系統(tǒng),帶來一種新型的離子導(dǎo)入的方法共創美好,被稱為壓縮離子導(dǎo)入或CII推動並實現,Skimmer、八極桿和個(gè)鏡頭的組合協調機製,把連續(xù)的離子流轉(zhuǎn)換為脈沖信息化,以便引進(jìn)到離子阱中。這種方法使得它可以在引入離子阱之前控制離子的積累實踐者,使得RF在所有CII積累的離子進(jìn)入離子阱的瞬間應(yīng)用于射頻環(huán)電極。LCMS-IT-TOF采用這種不同于傳統(tǒng)離子阱的控制約定管轄。CII的發(fā)展有效地將LC系統(tǒng)連接至MS數據,并且極大地改善了離子阱捕獲率,克服了以前的缺陷發揮,從而提高了靈敏度顯著。

LCMS-IT-TOF

LCMS-IT-TOF

圖1和圖2顯示A肟(ERY-AO)的UV和MS色譜,這是一個(gè)由應(yīng)變產(chǎn)生的細(xì)菌開放以來,稱為Saccaropolyspora的大環(huán)內(nèi)酯類抗生素占。一些雜質(zhì)被標(biāo)示出來。圖3顯示了A肟(ERY-AO)的質(zhì)譜圖。AO的分子顯示為m/z =747.4661激發創作。獲得數(shù)據(jù)字和理論值之間的質(zhì)量差(747.4643)約為0.002前景。

如圖4所示的MS/MS譜圖的m/z=747。大峰的m/z=571增幅最大,被視為A區(qū)AO結(jié)構(gòu)的損失共享應用,因?yàn)橘|(zhì)量差與M/Z=747是176。在m/z=396.2416被視為C區(qū)最新。這是高度可靠的數(shù)字技術創新,因?yàn)榕c理論的數(shù)字相比,其質(zhì)量差僅為0.003重要作用。

LCMS-IT-TOF

LCMS-IT-TOF

圖6顯示了雜質(zhì)A的質(zhì)譜圖:MS/MS譜圖表明ERY-AO具有類似的結(jié)構(gòu)持續向好。

與C區(qū)(396.2386)理論圖相比,m/Z=396.2406的質(zhì)量差為0.002充足。M/Z=571也進(jìn)行了檢測(cè)進展情況,它是類似于ERY-AO的MS/MS譜圖。然而方案,雜質(zhì)的分子量是733應用的選擇,雜質(zhì)A和從該損失之間的雜質(zhì)的質(zhì)量差是162。而從地區(qū)ERY-AO質(zhì)量差是14.0144左右。使用精確質(zhì)量計(jì)算器背景下,這個(gè)數(shù)字被認(rèn)為是CH2(14.0156),并假設(shè)雜質(zhì)有一個(gè)結(jié)構(gòu)可靠保障,從一個(gè)區(qū)的甲基A組自然條件,以一個(gè)氫取代。

智能自動(dòng)MSn功能

樣品一旦進(jìn)入LC / MS便不能重復(fù)采集分析開展;因此互動互補,至關(guān)重要的是,儀器可以自動(dòng)選擇合適的母離子意向。利用LCMS-IT-TOF意料之外,各種離子選擇標(biāo)準(zhǔn)都可使用,如根據(jù)離子的強(qiáng)度或m/z 形式,以及智能自動(dòng)母離子選擇置之不顧,如單同位素峰選擇和帶電狀態(tài)的過濾。

LCMS-IT-TOF

按強(qiáng)度順序選擇母離子

中性丟失分析原則

如果的中性丟失在MS2的譜圖中觀察到數字化,則MS3分析自動(dòng)進(jìn)行方便。中性丟失分析中,只有目標(biāo)離子在MS3中進(jìn)行測(cè)量各領域,從而有效的獲得所需信息應用領域,而不浪費(fèi)時(shí)間保持競爭優勢。

由于有關(guān)目標(biāo)離子的詳細(xì)信息,可以通過使用中性丟失分析功能得到發展機遇,它可以成為一個(gè)支持化合物鑒定的強(qiáng)大工具(例如完成的事情,藥物研發(fā)中的二相代謝產(chǎn)物)。

LCMS-IT-TOF

中立丟失分析功能示例中性丟失分析和MS3的測(cè)量相結(jié)合可以使用,提供了準(zhǔn)確的質(zhì)量信息進入當下,可進(jìn)行高度可靠的磷脂結(jié)構(gòu)分析

LCMS-IT-TOF

設(shè)置PS(極性基團(tuán) X:) - 特定NL (87Da) ,并進(jìn)行中性丟失分析

LCMS-IT-TOF

分子式預(yù)測(cè)軟件(備選產(chǎn)品)

精確MSn 的有效性

LCMS-IT-TOF

在組成預(yù)測(cè)中效高化,目標(biāo)成分有一個(gè)小的質(zhì)量和質(zhì)量精度新體系,其測(cè)量值,提供數(shù)量較少的候選化合物和提高預(yù)測(cè)的可靠性創造。當(dāng)使用公式預(yù)測(cè)的信息豐富的MSn 數(shù)據(jù)軟件時(shí)不難發現,公式預(yù)測(cè)從子離子中最小的質(zhì)量的離子開始,并使用在母離子的候選數(shù)量減少的有效預(yù)測(cè)結(jié)果設備製造。

LCMS-IT-TOF

公式預(yù)測(cè)軟件窗口

LCMS-IT-TOF

舉個(gè)例子來說發展需要,預(yù)測(cè)離子的m/z371.1645元素組成的情況下。正確的成分是C17H26N2O5S+的H+(m/z為371.1641)管理。
組合預(yù)測(cè)過程如下:

LCMS-IT-TOF

LCMS-IT-TOF

這樣顯示,使用同位素的模式,使正確的公式效率和安,以實(shí)現(xiàn)較高的排名設計能力。此外,使用MSn的數(shù)據(jù)深入開展,可減少候選化合物數(shù)量更為一致。

LCMS-IT-TOF

LCMS- IT -TOF采用廣泛應(yīng)用的電離ESI方法,然而APPI (大氣壓光電離)和APCI (APCI電離)方法為更多的低極性物質(zhì)的離子化提供了選擇技術的開發。 APPI (大氣壓光電離源)研究與應用,是其中的電離樣品離子化,使用紫外線燈更高效。 APCI(APCI電離)是在分析樣品受到電暈針放電的電離全面協議。 APPI達(dá)到良好的低到中等極性化合物的電離,而APCI是適合于中等極性的物質(zhì)具體而言。使用這些電離方法新的動力,可以預(yù)期進(jìn)一步擴(kuò)大LCMS- IT - TOF的應(yīng)用。電離方法的選擇是基于樣品性質(zhì)發展契機。

APPI-IT-TOF(LCMS-IT-TOF大氣壓光電離包:APPI+APCI)

· 支持APPI, APCI促進進步, APPI / APCI組合模式去突破。
· APPI采用紫外線能運用,而APCI通過與反應(yīng)離子(來自溶劑)進(jìn)行離子-分子反應(yīng)獲得離子化。
· 對(duì)于低到中等極性化合物(多環(huán)芳烴智能設備,某些真菌毒素等的分析)不可缺少。
· LCMS-IT-TOF的儀器控制和數(shù)據(jù)處理軟件LCMSsolution。

LCMS-IT-TOF大氣壓力化學(xué)電離源套件

· 支持APCI電離特點。
· APCI通過反應(yīng)離子(來源于溶劑)進(jìn)行離子 - 分子反應(yīng)來進(jìn)行電離積極回應。
· 對(duì)于中等極性物質(zhì)的分析(類固醇,脂質(zhì)體又進了一步,糖類多種場景,農(nóng)藥等)。
· LCMS-IT-TOF儀器控制和數(shù)據(jù)處理軟件LCMSsolution規劃。

APPI和 APCI電離方法的原理及組件

大氣壓光電離( APPI )


LCMS-IT-TOF

這是一個(gè)新的電離方法擴大公共數據,使用紫外線對(duì)樣品進(jìn)行電離。擅長(zhǎng)于低極性化合物的高靈敏度電離方法帶動擴大。APCI加熱器和噴霧器用于蒸發(fā)樣品核心技術體系。( APPI和APCI組合電離也可以使用同步的紫外線輻射和電暈放電)。


直接APPI如果分析目標(biāo)電離能量比光子的能量低持續發展,離子M +光子離子接收來自溶劑中的氫質(zhì)子必然趨勢,成為 [M + H] + 。

LCMS-IT-TOF

加入的化合物稱為摻雜擴大,電離能低于分析目標(biāo)多樣性,有時(shí)可以增加靈敏度。

LCMS-IT-TOF

APCI電離(APCI)

這是一種電離方法進行探討,通過反應(yīng)離子產(chǎn)生離子 - 分子反應(yīng)而電離樣品落到實處。樣品溶液進(jìn)入加熱器(約400℃ )后被霧化氮?dú)忪F化,形成噴霧最新,兩個(gè)樣品和溶劑分子被蒸發(fā)成氣態(tài)技術創新。溶劑分子通過電暈放電電離,形成穩(wěn)定的反應(yīng)離子重要作用。這些反應(yīng)離子與樣品分子(離子 - 分子反應(yīng))之間發(fā)生質(zhì)子轉(zhuǎn)移持續向好,樣品分子添加或失去質(zhì)子成為離子。這種離子 - 分子反應(yīng)以各種各種形式出現(xiàn)充足,如質(zhì)子轉(zhuǎn)移反應(yīng)進展情況,親電加成反應(yīng)等,同ESI一樣 同期,檢測(cè)質(zhì)子化的分子(或去質(zhì)子化分子)生產效率,因此它被用于分析高脂溶性化合物和在溶液中不電離的化合物。

分析實(shí)例

LCMS-IT-TOF

MTDATA [ 4,4 '效果,4 “ - 三( 3 -甲基phenylphenylamino的)三苯胺]是一種作為有機(jī)EL元素的典型材料使用。用APPI模式合規意識,觀測(cè)到的基峰為分子離子M + ,而在APCI電離模式有效性,它是質(zhì)子化分子[M + H ] + 創新內容。基于每一精確質(zhì)量是有可能鑒定其為MTDATA的廣泛關註。使用APCI善於監督,可觀察到MTDATA的裂解碎片離子 m / z值為530.2628,607.3000和698.3422 就能壓製,用APPI僅觀察到分子離子更合理,而且沒有發(fā)生任何斷裂。

LCMS-IT-TOF

MetID解決方案對(duì)代謝前效果、后樣品數(shù)據(jù)進(jìn)行比較有所應,然后對(duì)預(yù)期和非預(yù)期的代謝產(chǎn)物進(jìn)行搜索。(見性能分析解決方案代謝軟件合作關系,深度搜索功能統(tǒng)計(jì)著力提升,針對(duì)在大量數(shù)據(jù)中的變化。)代謝樣品中所產(chǎn)生的峰值(不出現(xiàn)在代謝前的樣品中)是的可能的代謝物傳遞,并結(jié)合組合預(yù)測(cè)工具中的同位素模式比較有力地支持高度精確的代謝物鑒定融合。對(duì)未知的代謝物候選化合物(不是預(yù)期中的代謝途徑物質(zhì)),多變量統(tǒng)計(jì)分析結(jié)合MSn 譜圖相關性,有效地篩選候選化合物和確定的代謝產(chǎn)物完成的事情。這種技術(shù)不僅可以應(yīng)用到代謝產(chǎn)物分析中,而且可以用于類似的化合物中污染物的識(shí)別和天然物質(zhì)化學(xué)的檢測(cè)和鑒定穩定。

· 操作簡(jiǎn)便
· 比較前和后的代謝樣品
· 通過多變量分析進(jìn)行候選代謝檢測(cè)
· 同步組成預(yù)測(cè)工具
· 支持Lhasa Meteor

樣品代謝前和代謝后比較

MetID解決方案可以用來比較代謝前改造層面、后的樣品,以檢查所形成的代謝產(chǎn)物的類型優勢與挑戰。以下是通過氧化反應(yīng)代謝分子式為C18H11N2時(shí)獲得的數(shù)據(jù)的解釋經驗分享。有圖顯示出化合物因氧化而改變。

LCMS-IT-TOF

在比較m/z為289.0739代謝前和代謝后的樣品的質(zhì)譜圖后趨勢,揭示了只在代謝后的樣品中觀察到的峰系列。因此,該物質(zhì)被判定為代謝產(chǎn)物相互配合。通過比較峰值慢體驗,代謝產(chǎn)物質(zhì)量數(shù)附近的任何物質(zhì),都可作為代謝產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)智能化。然而科技實力,高分辨率,高精確度的島津LCMS-IT-TOF,因?yàn)槭鞘褂镁_的質(zhì)量寬度(XIC:提取離子色譜圖)繪制的圖譜之間進(jìn)行的比較勃勃生機,所以具有很高的可靠性評(píng)估助力各業。

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m/z289.739質(zhì)譜圖

代謝途徑往往遵循典型模式,如氧化反應(yīng)等提供有力支撐,則使用MetID解決方案,可以判斷衍生出的代謝物的存在建議。然而品率,由于不太典型的代謝途徑也存在,因此在整個(gè)測(cè)量質(zhì)量范圍比較質(zhì)量色譜圖不斷發展,同時(shí)對(duì)各自的樣品之間的差異也會(huì)進(jìn)行評(píng)估積極影響。由于組分預(yù)測(cè)被應(yīng)用到這些差異,可以判斷他們是否可以從母體化合物進(jìn)行代謝緊密協作。這些結(jié)果顯示在如下所示的窗口中越來越重要。

LCMS-IT-TOF

多變量分析檢測(cè)候選代謝物

母離子分析


LCMS-IT-TOF

由于(n(2))母體化合物和代謝產(chǎn)物的MSn譜圖之間經(jīng)常有一些相關(guān)性,因此采用統(tǒng)計(jì)分析(PLS方法之間的相關(guān)性類型:偏最小二乘法)的方法發揮重要作用,對(duì)MSn譜圖之間的相關(guān)性和每個(gè)母離子進(jìn)行分析醒悟。

基本上,如果母體化合物進(jìn)行代謝高質量,那么很有可能代謝物的一部分將繼續(xù)保持與母體化合物一致的結(jié)構(gòu)也逐步提升。因此,利用其能夠在代謝物MSn譜圖中找到母體化合物和產(chǎn)物離子及中性丟失之間共同點(diǎn)的功能註入了新的力量,高度相關(guān)性的母離子會(huì)作為候選代謝物自動(dòng)提取出來重要的作用。


分析結(jié)果顯示在下面所示的窗口。在左上角繪制每個(gè)母離子和母體化合物的離子之間的相關(guān)性去創新。高相關(guān)性的前體離子沿X軸分布在該區(qū)域足夠的實力,大于0。另外結構,這些前體離子列表顯示在窗口底部結構重塑。

LCMS-IT-TOF

母離子分析窗口

MetID解決方案可以自動(dòng)生成獲取MS/MS譜圖的方法。保留時(shí)間新的力量,質(zhì)譜先進水平,MS和MS/MS譜精確質(zhì)量信息可通過單一的分析獲取,除了使用比以前更少的分析來確定預(yù)期的代謝產(chǎn)物外全面展示,它能夠可靠和有效的檢測(cè)和預(yù)測(cè)未知的代謝產(chǎn)物重要平臺。

預(yù)測(cè)候選代謝物的元素組成

即使是未知的代謝物,也可以通過組分預(yù)測(cè)工具從候選代謝物的分子式和母藥之間的差異中得到代謝的線索核心技術。利用精確質(zhì)量數(shù)可以自動(dòng)預(yù)測(cè)未知代謝物的組成應用提升。高精確度的預(yù)測(cè),通過比較質(zhì)譜圖的同位素模式是有可能實(shí)現(xiàn)的創造性。

LCMS-IT-TOF


LCMS-IT-TOF

通過代謝組學(xué)的方法分析從龐大樣品量或化合物中獲取的復(fù)雜數(shù)據(jù)文件的差異性發展的關鍵,從而闡明代謝途徑和控制機(jī)制道路,為包括藥品,食品和環(huán)境在內(nèi)的學(xué)術(shù)研究和應(yīng)用領(lǐng)域提供了功能強(qiáng)大的工具真諦所在。自動(dòng)檢測(cè)并列出大量數(shù)據(jù)的峰值指導,是代謝和差異分析中最重要的一步。

輪廓解決方案軟件自動(dòng)按保留時(shí)間將由LCMS-IT-TOF質(zhì)譜儀獲得的高準(zhǔn)確性數(shù)據(jù)排列充分,并生成可以用于商業(yè)多變量分析軟件的列表(矩陣)進一步完善。這大大減少峰值獲取和列表創(chuàng)建的工作量,由于大量的數(shù)據(jù)點(diǎn)和樣品組分競爭力,這個(gè)過程可能需要一段相當(dāng)長(zhǎng)的時(shí)間調整推進。


注1)配置解決方案軟件不提供多變量的分析功能。
注2)推薦使用MetID解決方案比較代謝前與代謝后的樣品機製性梗阻,以幫助搜索可預(yù)測(cè)的和未知的代謝產(chǎn)物指導。

特點(diǎn)

1更多的合作機會、從大量的數(shù)據(jù)文件自動(dòng)提取和顯示峰值振奮起來。對(duì)齊色譜峰提供更準(zhǔn)確的峰值評(píng)估講故事。
2、同時(shí)顯示多個(gè)色譜使用。
3合規意識、支持集中的QA/QC樣品。過濾表中顯示的峰值信息有效性。

代謝組學(xué)分析實(shí)例:綠茶葉的質(zhì)量評(píng)估創新內容。

從大量的數(shù)據(jù)文件自動(dòng)提取和顯示峰簡(jiǎn)單地拖放多個(gè)數(shù)據(jù)文件,然后按一下[執(zhí)行]按鈕執(zhí)行峰值獲取創新科技,并列出每個(gè)峰的m/z值服務延伸、保留時(shí)間和信號(hào)強(qiáng)度。此表可作為多變量分析數(shù)據(jù)具有重要意義,通過商業(yè)統(tǒng)計(jì)計(jì)算軟件進一步,如由Umetrics開發(fā)的SIMCA-P來進(jìn)行分析。

色譜自動(dòng)校正(調(diào)整)保留時(shí)間的細(xì)微變化強大的功能,允許更精確的峰值評(píng)價(jià)實際需求,即使每次運(yùn)行中存在波動(dòng)。

LCMS-IT-TOF

同時(shí)顯示多個(gè)色譜圖

可以顯示所有數(shù)據(jù)的色譜和質(zhì)譜圖優勢。提供運(yùn)行(分組善謀新篇,積分,邏輯運(yùn)算)和信號(hào)強(qiáng)度的過濾功能可對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行比較和查看便利性。

LCMS-IT-TOF

支持合并的QA/QC樣品

支持合并的QA/QC 樣品方法,其中包括混合小批量的目標(biāo)樣品所作的分析控制,有助于有效地發(fā)現(xiàn)峰值的差異。歸一化處理峰面積值(數(shù)值顯示或相對(duì)強(qiáng)度顯示)切實把製度,操作和過濾增強(qiáng)和可視化面積的差值保供,可追蹤相對(duì)量的變化。

蛋白質(zhì)分析軟件 (選件)

LCMS-IT-TOF自動(dòng)化功能的優(yōu)勢(shì)進行部署,可以得到最充分的開發(fā)利用責任。使用蛋白的方法創(chuàng)建一個(gè)峰值列表,并設(shè)置數(shù)據(jù)庫(kù)的搜索參數(shù)利用好,允許所有操作從分析到蛋白質(zhì)鑒定的自動(dòng)化深入各系統。鑒定結(jié)果可以直接通過蛋白質(zhì)分析軟件瀏覽,數(shù)據(jù)管理既簡(jiǎn)便又確定系列。方法重建也可以進(jìn)行參數(shù)修改。

NanoESI 接口 (選件)

nano Electrospray NES-100

獲取更高靈敏度的高精度LCMS-IT-TOF數(shù)據(jù)相互配合!納升噴霧提供高電離效率并減少損失慢體驗。使用NanoESI(納米電噴霧)接口允許超低樣品量進(jìn)行較高靈敏度的分析。拆裝也很容易智能化,與標(biāo)準(zhǔn)的ESI接口相比科技實力,并不需要更多的工作。

分析示例: 酶切的BSA (50 fmol)

當(dāng)用高效液相色譜法分離一種蛋白質(zhì)酶切產(chǎn)物時(shí)建設,可以觀察幾十到數(shù)百個(gè)峰值在此基礎上。因此,多個(gè)肽在幾秒鐘之內(nèi)洗脫并不罕見姿勢。在這種情況下相互融合,高速且智能自動(dòng)的MSn分析提供了更高的覆蓋率。此外綠色化,MS高精度質(zhì)譜圖有助于進(jìn)一步改善蛋白質(zhì)分析的可靠性不同需求。蛋白質(zhì)分析軟件窗口如下圖所示”3址€定?梢酝瑫r(shí)觀看到每個(gè)數(shù)據(jù)文件的MS數(shù)據(jù)以及Mascot的搜索結(jié)果總之。

LCMS-IT-TOF

LCMS-IT-TOF

Mascot的搜索結(jié)果顯示出BSA獲得1180的得分。此外支撐作用,所有搜索結(jié)果在4ppm的質(zhì)量誤差范圍內(nèi)的肽都被對(duì)應(yīng)(外標(biāo)法)研學體驗。這即是當(dāng)使用高精度LCMS-IT–TOF可能獲得一個(gè)高質(zhì)量的分析實(shí)例。

LCMS-IT-TOF

島津大力支持代謝組學(xué)的研究最為突出。提供分析各種生物樣品的高分離性能的分離工具落實落細,在線精確質(zhì)量測(cè)定工具,以及有效地從大量采集數(shù)據(jù)中提取所需信息的工具發展目標奮鬥。這些儀器設(shè)備技術先進,都旨在充分利用技術(shù)優(yōu)勢(shì),實(shí)現(xiàn)高精度和高速處理。

[1] 什么是代謝組學(xué)?


LCMS-IT-TOF

代謝組學(xué)是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分認為,其中包括低分子量的化合物服務好,如有機(jī)酸和氨基酸代謝產(chǎn)物(代謝組學(xué)研究)分析。因此反應能力,基因組學(xué)重點(diǎn)研究DNA共謀發展,轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重點(diǎn)是mRNA以及蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重點(diǎn)是蛋白質(zhì),而代謝組學(xué)重點(diǎn)研究整體代謝產(chǎn)物結構重塑。

DNA和蛋白質(zhì)受食品聽得懂、藥品、運(yùn)動(dòng)和各種壓力等環(huán)境因素的影響高質量發展。其相互作用的結(jié)果反映在留下的代謝產(chǎn)物中全方位,因此可以說,代謝組學(xué)承擔(dān)著測(cè)量體內(nèi)基因和蛋白質(zhì)的活動(dòng)影響力範圍,以及環(huán)境影響的總和大局。由于代謝組學(xué)可用于獲得有關(guān)生物功能的有價(jià)值的信息,其應(yīng)用已經(jīng)延伸到廣泛的研究領(lǐng)域邁出了重要的一步,從生物標(biāo)記物的發(fā)現(xiàn)項(xiàng)目(藥物代謝動(dòng)力學(xué)宣講手段,藥物的安全性,藥物毒性等)來診斷疾病積極拓展新的領域、生活習(xí)慣和健康配套設備。


[2] 代謝組學(xué)分析流程


LCMS-IT-TOF

可大致分為以下幾步:
第1步項(xiàng)目構(gòu)想第2步實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
步驟3差異代謝產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)
步驟4差異代謝產(chǎn)物的鑒定
步驟5假說,驗(yàn)證相對開放,結(jié)論


[第1步 項(xiàng)目構(gòu)想 ]

要啟動(dòng)一個(gè)項(xiàng)目推進高水平,必須有一些要解決的問題,如藥物深入交流研討、食物或環(huán)境相關(guān)的問題資料,(例如,“這種藥物為什么是毒性的關註度,或?yàn)槭裁催@種食物具有降壓功效” )橫向協同,或與疾病相關(guān)的問題,或基因組學(xué)/蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)的問題(例如敢於挑戰,“該基因或蛋白質(zhì)的功能是什么” ) 不斷創新。這個(gè)問題就成為該項(xiàng)目的構(gòu)想。

[第2步 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)]

代謝可以有各種方法提供了遵循,所以重要的是分析項(xiàng)目時(shí)參與水平,要進(jìn)行實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),以便得到有意義的結(jié)果服務效率。例如明確相關要求,應(yīng)該培養(yǎng)細(xì)胞重要意義,用于臨床前樣品,或應(yīng)該使用動(dòng)物疾病模型深化涉外,而對(duì)于臨床樣品體系,應(yīng)該使用一個(gè)健康人的樣品(I期)或疾病樣品(II期和之后),并且樣品本身應(yīng)包括組織和細(xì)胞或生物體液開展試點,如血漿攜手共進,血清或尿液。此外推進一步,決定那些考慮系統(tǒng)的生物變異樣品的數(shù)量是有必要的經過。

[第3步 差異代謝產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)]

發(fā)現(xiàn)差異代謝物的方法大致可分為兩類。
(1)非目標(biāo)代謝組學(xué)
這是指在所有化合物中搜索差異代謝物力度,并強(qiáng)調(diào)深入的搜索技術(shù)明確了方向,這是一個(gè)強(qiáng)大的方法。它涉及到相對(duì)定量分析業務指導。
(2)目標(biāo)代謝組學(xué)
在這種方法中基礎,已知代謝產(chǎn)物進(jìn)行選擇性分析。對(duì)相對(duì)定量分析加以考慮還不大,多個(gè)樣品濃度輪廓分析是可行的。

代謝組學(xué)涉及到不同的技術(shù)相關(guān)的方法信息化技術,包括利用色譜 - 質(zhì)譜和核磁共振等發揮作用。當(dāng)使用色譜 - 質(zhì)譜方法時(shí),測(cè)量數(shù)據(jù)的不斷進(jìn)步首先表現(xiàn)在保留時(shí)間和質(zhì)量分析上逐步顯現。如果保留時(shí)間校準(zhǔn)和調(diào)整是必要的銘記囑托,則要使用相同的樣品進(jìn)行反復(fù)測(cè)量樣品。比如說尋找用藥物產(chǎn)生的差異代謝產(chǎn)物自動化裝置,將必然涉及大量數(shù)據(jù)的產(chǎn)生示範。這是由于用藥后,在一定的時(shí)間間隔采樣而產(chǎn)生了多個(gè)數(shù)據(jù)有很大提升空間,以及生物變異和母體變異的可能性運行好。因?yàn)閺娜绱硕嗟姆治龅臉悠分猩删薮髷?shù)量的數(shù)據(jù),所以分析軟件變得幾乎可能性更大。因此部署安排,代謝產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)通常使用專門的應(yīng)用軟件,以加工處理獲得的數(shù)據(jù)技術,如校正保留時(shí)間和質(zhì)量推廣開來,調(diào)整和歸一化操作,以及進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析和數(shù)據(jù)挖掘等操作相對較高。

[第4步 差異代謝產(chǎn)物的鑒定]

反復(fù)核對(duì)注冊(cè)在數(shù)據(jù)庫(kù)中的化合物資源配置,以確定在第3步中發(fā)現(xiàn)的代謝產(chǎn)物信息,通過化合物信息分析確定其結(jié)構(gòu)。國(guó)內(nèi)和國(guó)際各種數(shù)據(jù)庫(kù)都在發(fā)展大力發展,其中包含MS / MS和其他參考譜圖豐富內涵,以及代謝途徑相關(guān)的化合物。因?yàn)樵谕ㄟ^參照數(shù)據(jù)庫(kù)和差異代謝產(chǎn)物信息的基礎(chǔ)上進(jìn)行的結(jié)構(gòu)鑒定之前還需要一些時(shí)間不同需求,將根據(jù)從MS和NMR等分析儀器獲得差異代謝物的信息來進(jìn)行結(jié)構(gòu)鑒定發展。

[ 5步假設(shè),驗(yàn)證總之,結(jié)論]

更差異代謝產(chǎn)物被發(fā)現(xiàn)和鑒定后面向,重新審視項(xiàng)目的構(gòu)想,建構(gòu)并驗(yàn)證一個(gè)假設(shè)同時,并得出一個(gè)結(jié)論互動式宣講。建構(gòu)一個(gè)有意義的假說和獲取結(jié)論需要重復(fù)性的數(shù)據(jù),從復(fù)雜樣品中分離出每個(gè)代謝產(chǎn)物(通常情況下模式,質(zhì)量分辨率和色譜分離度的組合)的手段自動化,用于ID驗(yàn)證的豐富數(shù)據(jù)(質(zhì)量準(zhǔn)確度和MSn信息),可以從大量數(shù)據(jù)中提取完成研究目標(biāo)信息的軟件高品質。

[3]島津代謝組學(xué)解決方案


LCMS-IT-TOF

色譜和質(zhì)譜的結(jié)合不折不扣,被廣泛用于代謝組學(xué),因?yàn)檫@種技術(shù)可達(dá)到化合物的高度分辨資源優勢。


發(fā)現(xiàn)差異代謝物高效利用,最重要的信息是保留時(shí)間。優(yōu)異的保留時(shí)間重現(xiàn)性是至關(guān)重要的估算,島津的Prominence HPLC系列獲得高度評(píng)價(jià)講理論,其優(yōu)異的性能適合代謝組學(xué)的研究。島津的LCMS-IT-TOF不要畏懼,以高速測(cè)量獲得MSn 精確質(zhì)量的功能服務為一體,結(jié)合Prominence高效液相色譜,可以提供準(zhǔn)確的信息逐漸顯現,以滿足這些目標(biāo)所需全會精神。

為了從這些儀器獲得的大量數(shù)據(jù)中有效地提取所需信息來完成研究項(xiàng)目,此系統(tǒng)需與輪廓解決方案代謝組學(xué)軟件組合更默契了。該軟件由在代謝組學(xué)和生物信息學(xué)具有廣泛認(rèn)可和專業(yè)知識(shí)經(jīng)驗(yàn)的PhenomenomeDiscoveries有限公司(加拿大)開發(fā)先進技術,以島津整體代謝組學(xué)解決方案的形式提供給客戶。

當(dāng)利用LCMS-IT-TOF的0.1秒高速質(zhì)譜采集并且與HPLC在線聯(lián)機(jī)進(jìn)行分析時(shí)不合理波動,僅需一次分析宣講手段,就能夠獲取MS譜,MS/MS和MS/MS/MS的譜圖積極拓展新的領域。LCMS-IT-TOF組成預(yù)測(cè)程序(正在申請(qǐng))有效的縮減了備選代謝物配套設備,不止使用同位素方法和還參考了MSN譜精確確的質(zhì)譜信息更優質。這就是該系統(tǒng)對(duì)于解決代謝最艱巨的任務(wù),識(shí)別發(fā)現(xiàn)的代謝物并有力支持應(yīng)用代謝學(xué)的項(xiàng)目的成功(如尋找生物標(biāo)志物)的巨大作用推進高水平。

化合物優(yōu)化處于藥物研發(fā)的深度研究階段脫穎而出,在化合物優(yōu)化的過程中,需要高通量代謝物的分析生產創效。為此註入新的動力,我們提供了一個(gè)包括代謝物結(jié)構(gòu)分析軟件MetID Solution的系統(tǒng)可以有效的發(fā)現(xiàn)并識(shí)別預(yù)期的或未知的代謝產(chǎn)物。

通過比較代謝前、后的XIC (精確質(zhì)量)色譜雙重提升,并對(duì)母藥和代謝物的MSn 譜使用多變量分析這個(gè)系統(tǒng)可以讓哪些即使不熟悉代謝研究分析人員都能自動(dòng)提取候選代謝物,從而有效提高實(shí)驗(yàn)室整體效能事關全面。

另一方面表現明顯更佳,關(guān)于發(fā)現(xiàn)代謝物的鑒定,值得注意的是目前正在重新關(guān)注于GCMS技術節能,因?yàn)檫@是一種可以輕松地分析小分子化合物(如氨基酸指導,有機(jī)酸和脂肪酸)的具有高靈敏度和高分辨率的方法。

島津提供GCMS系統(tǒng)國際要求,包括為分析和鑒定某些特定的氨基酸流動性,有機(jī)酸和脂肪酸的GCMS-QP2010Plus,具有自動(dòng)保留時(shí)間校正的GCMSsolution軟件(版本2.5和更高版本)競爭激烈,以及GCMS代謝物數(shù)據(jù)庫(kù)追求卓越。使用具有保留指數(shù)的代謝物數(shù)據(jù)庫(kù),候選化合物范圍可以大大縮小參與能力,從而獲得高度可靠的鑒定。

LCMS-IT-TOF

配備了離子阱的LCMS-IT-TOF與高效液相色譜在線配置能獲得精確的n級(jí)質(zhì)譜檢測(cè)是目前主流。

LCMS-IT-TOF

通過輪廓解決方案代謝組學(xué)軟件對(duì)目標(biāo)候選化合物的高效搜索充分發揮,大大提高了研究的效率。

LCMS-IT-TOF

代謝物結(jié)構(gòu)分析軟件MetID的解決方案對(duì)代謝前充分發揮、后數(shù)據(jù)進(jìn)行比較選擇適用,搜索預(yù)期和未知的代謝產(chǎn)物。

下面介紹的示例是關(guān)于綠茶葉輪廓分析的方法設計,分析決定綠茶質(zhì)量的成分業務指導。

1. 前處理與分析

分析樣品來自綠茶博覽會(huì)中排名靠前的九種高級(jí)綠茶葉,使用 Prominence UFLC/LCMS-IT-TOF 進(jìn)行分析就此掀開。

LCMS-IT-TOF

2. 峰提取與列表創(chuàng)建——通過Profiling Solution軟件提取峰

分別從MS1的分析中提取峰和使用峰信號(hào)強(qiáng)度值創(chuàng)建峰列表長足發展。峰保留時(shí)間排序,同位素峰消除穩步前行, p值過被應(yīng)用到3798個(gè)檢測(cè)到的峰值中結構不合理,從中提取出479個(gè)顯著峰值動手能力。然后把數(shù)據(jù)輸出到商業(yè)的多變量分析軟件中( SIMCA-P, Umetrics開發(fā) ) 效果較好。

LCMS-IT-TOF

3. 多變量分析

PCR技術(shù)得分和PCR量值圖生成重要的意義。茶博會(huì)上排名靠前的綠茶葉和排名靠后的茶葉被劃分到左邊和右邊的PCR分值圖上,這樣等多個領域,主成分軸指示出級(jí)別的差異性再獲。

LCMS-IT-TOF

主要成分軸( PC1)的PCR量值圖(顯示每個(gè)成分對(duì)茶葉品質(zhì)的貢獻(xiàn)率),顯示了大量高級(jí)茶葉所含的成分呈現(xiàn)正值應用擴展。

LCMS-IT-TOF

4.未知化合物的分子式預(yù)測(cè)

選擇一個(gè)典型對(duì)茶葉品質(zhì)有貢獻(xiàn)的候選未知化合物峰X體驗區,并預(yù)測(cè)其分子式。從MS3的分析中獲得的準(zhǔn)確質(zhì)量的信息用于預(yù)測(cè)分子式進一步意見。分子式預(yù)測(cè)軟件(Formula Predictor)顯示峰X為C14H16O10增幅最大。

LCMS-IT-TOF

5.候選未知化合物的預(yù)測(cè)

在互聯(lián)網(wǎng)上發(fā)布的數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索一個(gè)分子式為C14H16O10顯示,該化合物可能是名為茶沒食子素(theogallin)的多酚生產能力。歸于基于茶沒食子素結(jié)構(gòu)的質(zhì)譜圖表明峰值X是茶沒食子素標準。



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