如何應(yīng)對細(xì)胞株系開發(fā)數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)
細(xì)胞株開發(fā)是眾多具有重大數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)的工作流程之一發展邏輯。與任何篩選過程一樣,樣本通量帶來了數(shù)據(jù)量的挑戰(zhàn)有所提升。當(dāng)使用多種分析工具以不同格式生成不同類型的數(shù)據(jù)時聽得進,這就變得更加具有挑戰(zhàn)性。這不僅需要在不同的孔板和孔之間移動數(shù)據(jù)先進水平,而且整個過程可能會延長數(shù)月便利性。在整個過程中,必須對數(shù)據(jù)進(jìn)行追蹤重要平臺,以確保進(jìn)入生產(chǎn)的任何細(xì)胞株都有必要的歷史數(shù)據(jù)(例如單克隆性的證明)深刻認識,并且為了報告需要,所有的數(shù)據(jù)都可以被方便地訪問應用提升。在這里主動性,我們將描述在Biomek i7工作站上自動化細(xì)胞株開發(fā)如何克服與此工作流程相關(guān)的許多數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)。
Biomek i7工作站與三方設(shè)備整合一起被用于自動化細(xì)胞株開發(fā)工作流程發展的關鍵。
作為液體轉(zhuǎn)移步驟的一部分道路,Biomek軟件會自動移動數(shù)據(jù)規模設備,因此數(shù)據(jù)可以隨著樣本移動而并行移動(圖4)。同時責任製,數(shù)據(jù)也可以存儲在DART數(shù)據(jù)庫中十分落實,未來任何時候掃描孔板條碼時,相應(yīng)的數(shù)據(jù)都會被自動檢索出來有序推進。DART提供了不同時間交互的方法之間的鏈接(圖4)——在諸如細(xì)胞株開發(fā)這樣的長時間工作流程中設施,這是一個關(guān)鍵組件。
圖3:自動化數(shù)據(jù)處理示意圖堅定不移。
除開存儲和利用數(shù)據(jù)組合運用,DART數(shù)據(jù)庫可以通過多種方便的方式訪問。為了以用戶友好的方式進(jìn)行快速可視化迎難而上,可通過Chrome瀏覽器直接實時查看(圖6A)積極,同時可以使用DART報告生成器在Excel中生成報告。
圖6:DART數(shù)據(jù)查看和報告堅持先行。
在任何實驗中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)使實驗有價值產業。數(shù)據(jù)處理中的任何錯誤都可能消除這個價值,甚至可能將研究進(jìn)程推向錯誤的方向情況較常見。對于像細(xì)胞株開發(fā)這樣長達(dá)數(shù)月的工作流程可持續,數(shù)據(jù)丟失或錯誤的風(fēng)險更大,因此體製,確保數(shù)據(jù)完整性的工具至關(guān)重要構建。Biomek和DART軟件通過使數(shù)據(jù)完整性過程自動化且易于獲取,可以為細(xì)胞株開發(fā)過程提供真正的價值服務延伸。
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