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高內(nèi)涵在模式生物中的應(yīng)用(一)

來源: 珀金埃爾默企業(yè)管理(上海)有限公司    2019年08月12日 09:25  
  生命科學(xué)研究離不開各式各樣的模式生物前來體驗,模式生物由于其結(jié)構(gòu)簡單、生活周期短確定性、培養(yǎng)簡單更加廣闊、基因組小等特點(diǎn),在生物醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域發(fā)揮重要作用講故事。模式生物作為材料不僅能回答生命科學(xué)研究中基本的生物學(xué)問題非常完善,對人類一些疾病的治療也有借鑒意義。常見的模式生物有真菌中的酵母全面革新,低等無脊椎動(dòng)物中的線蟲作用,昆蟲綱的果蠅,魚綱的斑馬魚行業分類,哺乳綱的小鼠以及植物中的擬南芥技術特點。
 
  高內(nèi)涵系統(tǒng)不僅僅適用于各種各樣的細(xì)胞模型,對各種小型的模式生物也非常友好發展邏輯,通過將這些模式生物做一些預(yù)處理凝聚力量,放在微孔板中,我們就可以用高內(nèi)涵系統(tǒng)來拍攝和分析它們聽得進。本期和下期新的力量,我們將隆重介紹高內(nèi)涵與這些模式生物的故事。
 
  酵 母
 
  常用于模式生物的酵母有兩個(gè)物種:出芽酵母和裂殖酵母更多可能性,以出芽酵母為例去創新,其細(xì)胞為球形或者卵形,直徑5–10μm緊迫性。其繁殖的方法為出芽生殖。使用高內(nèi)涵系統(tǒng)更適合,可以觀察和分析酵母的世代周期高效、蛋白定位等。
 
  實(shí)驗(yàn)一
 
  Hoechst 33342 染色酵母活細(xì)胞高質量發展,通過63倍水浸式物鏡拍攝酵母細(xì)胞全方位,高內(nèi)涵分析軟件Harmony自動(dòng)識別酵母細(xì)胞,PhenoLOGIC人工智能算法區(qū)分出芽細(xì)胞:
 
實(shí)驗(yàn)二
 
  酵母細(xì)胞器相關(guān)蛋白的標(biāo)記影響力範圍,紅色標(biāo)記整個(gè)酵母細(xì)胞大局,綠色為不同細(xì)胞器,高內(nèi)涵分析軟件Harmony可識別不同的細(xì)胞器結(jié)構(gòu)邁出了重要的一步,分析其熒光強(qiáng)度有序推進、形態(tài)學(xué)參數(shù)和紋理參數(shù)[1]設施。
 
下圖為突變體中蛋白定位發(fā)生變化[1]。
 
斑馬魚
 
  斑馬魚也是成熟且常見的模式生物堅定不移,常用于疾病研究中組合運用。斑馬魚成魚體長5cm左右,幼魚0.5-2cm迎難而上,全身透明積極。一般首先對斑馬魚進(jìn)行麻醉,再進(jìn)行高內(nèi)涵拍攝堅持先行。
 
  實(shí)驗(yàn)一
 
  斑馬魚曲度的研究產業,毒性處理或一些基因突變會(huì)導(dǎo)致斑馬魚的曲度發(fā)生變化,高內(nèi)涵分析軟件Harmony可分析斑馬魚的軸向長度情況較常見、曲率可持續、彎曲角度等參數(shù):
 
實(shí)驗(yàn)二
 
  斑馬魚血管研究,斑馬魚全身透明機製,一直以來都是非常好的心血管研究模式生物全過程,通過20倍水浸式物鏡(NA1.0)對斑馬魚血管進(jìn)行成像,高內(nèi)涵分析軟件Harmony可通過一系列算法識別熒光標(biāo)記的斑馬魚血管結(jié)構(gòu)探討,也可對血管結(jié)構(gòu)做3D重構(gòu)不負眾望,分析血管長度、熒光強(qiáng)度等參數(shù):
 

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