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脈沖場凝膠電泳是近年發(fā)展起來的分離效果較好的DNA分離方法,可以有效分離50kb甚至10Mb的DNA大片段自行開發。因此脈沖電泳儀已經(jīng)成為DNA分離的主要儀器進行部署。脈沖電泳儀的使用條件對DNA分離速度與效果有很大影響,主要包括以下幾點:
1.電泳緩沖液
在脈沖電泳時常使用的電泳緩沖液有三種自動化裝置,不同緩沖液的離子強(qiáng)度不同示範,電泳速度也不同。
2.瓊脂糖種類及濃度
瓊脂糖種類對脈沖場電泳雖然影響不是甚大,但也有一定程度影響有很大提升空間。低電滲(EEO)的瓊脂糖使電泳速度加快運行好。有條件的情況下,使用超純瓊脂糖可產(chǎn)生較好的分離效果可能性更大。凝膠的濃度太低部署安排,使泳動速度加快,不利于較小或中等長度DNA片段的分離技術。膠的濃度太大推廣開來,則影響大分子DNA的分離。因此要根據(jù)具體情況相對較高,選用不同濃度的膠資源配置。在一-般情況下,常采用的凝膠濃度為1~1.4%姿勢。
3.電壓
6~10伏特/cm的電壓梯度诚嗷ト诤??墒箮资甼b到1000kb的DNA片段得到有效分離。如果想分離更長的DNA片段綠色化,則應(yīng)適當(dāng)降低電壓梯度不同需求。
4.變換電場方向的時間間隔
開關(guān)(即變換電場方向)的時間間隔對電泳效果影響較大。DNA在泳動過程中再定向所需的時間和DNA的大小呈正相關(guān)保持穩定,因此較大的DNA分子需要較長的開關(guān)時間間隔總之。在確定了開關(guān)時間間隔的情況下,小于一定尺寸的DNA分子能夠隨著電場方向的變化再定向并在新電場影響下泳動支撐作用,而大于一定尺寸的DNA分子在再定向尚未完成時便發(fā)生了開關(guān)的再次變化研學體驗,因此不能泳動和得到有效分離。
5.溫度
電泳時通過循環(huán)裝置使緩沖液保持恒定是重要的最為突出。溫度的高低對電泳速度也有重要影響落實落細。
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