RNA-seq即轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)高質量，就是把mRNA，smallRNA迎來新的篇章，and NONcoding RNA等或者其中一些用高通量測(cè)序技術(shù)把它們的序列測(cè)出來共創美好。反映出它們的表達(dá)水平。

RNA-seq高通量測(cè)序技術(shù)薄弱點，也就是下一代測(cè)序技術(shù)已經(jīng)成為現(xiàn)代生物學(xué)研究的一個(gè)較為常規(guī)的實(shí)驗(yàn)手段了覆蓋範圍。這一技術(shù)的發(fā)展*地推動(dòng)了基因組學(xué)，表觀基因組學(xué)以及翻譯組學(xué)的研究積極性。RNA-seq通過測(cè)定穩(wěn)定狀態(tài)下的RNA樣品的序列來對(duì)RNA樣品進(jìn)行研究奮勇向前，從而避免了許多之前研究手段的不足，比如象基因芯片或者PCR就需要背景知識(shí)實施體系。而且RNA-seq還可以觸及以前無法研究的領(lǐng)域組建，比如復(fù)雜結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄體。RNA-seq可以應(yīng)用于以下幾個(gè)方面的研究效果較好，1. SNPs重要的意義；2. novel transcripts；3. alternative splicing開放以來；4. RNA editing。無論如何高質量，使用RNA-seqzui多的還是比較兩組樣品基因水平表達(dá)差異提供了有力支撐，比如野生型與突變型激發創作，用藥組與對(duì)照組，不同組織之間進一步意見，癌細(xì)胞與正常細(xì)胞增幅最大，等等。我們把這種基因水平差異表達(dá)生產能力，簡(jiǎn)稱為DE (differential expression標準，注，不是ED啊???)堅持好。

常用的RNA-seq操作平臺(tái)有Illumina GA/ HiSeq, SOLiD 還有Roche 454即將展開。它們都是提取RNA后，純化特性，打碎傳承，逆轉(zhuǎn)錄成cDNA，然后測(cè)序建言直達。測(cè)序的結(jié)果被稱為short reads多種，短序。通常一個(gè)短序的長(zhǎng)度為25-300bp之間不久前。如果測(cè)序只測(cè)一端可能會(huì)帶來比對(duì)時(shí)的困難用上了，于是這些操作平臺(tái)提供了兩端都測(cè)的辦法，這樣的結(jié)果成對(duì)出現(xiàn)能力建設，中間有一定的間隔關註，但是因?yàn)闇y(cè)序長(zhǎng)度一下子提高了一倍，所以比對(duì)會(huì)精準(zhǔn)很多設計標準。人們把這種測(cè)序結(jié)果稱為’paired-end’ reads開展，成對(duì)短序。一般來講發揮重要帶動作用，測(cè)序結(jié)果會(huì)直接轉(zhuǎn)換成一行一行的由字母組成的短序列意向，可能是fasta,fastq等等不同格式。

一般的來講文化價值，RNA-seq后DE的工作流程是這樣的（圖1）形式，首先，將短序映射到基因組相應(yīng)的位置上去不斷完善，其次數字化，對(duì)映射的結(jié)果進(jìn)行基因水平，外顯子水平基礎上，以及轉(zhuǎn)錄水平的拼接各領域，而后對(duì)結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)，標(biāo)準(zhǔn)化之后生成表達(dá)水平報(bào)告文件，zui后由生物學(xué)者依據(jù)系統(tǒng)生物學(xué)相關(guān)知識(shí)進行培訓，來對(duì)數(shù)據(jù)結(jié)果進(jìn)行分析發展機遇。

RNA-seq分析工作流程

RNA-seq服務(wù)內(nèi)容：大數(shù)據(jù)分析，整體課題的分解法治力量，真實(shí)的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)全技術方案，完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告及分析。