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基因芯片

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基因芯片廣泛用于模式物種的DNA全面闡釋、RNA和表觀遺傳等研究非常激烈。豐核信息提供SNP芯片競爭力所在、RNA芯片貢獻法治、甲基化芯片分析服務,涵蓋人類和主要模式物種發展需要。

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基因芯片廣泛用于模式物種的DNA攻堅克難、RNA和表觀遺傳等研究。豐核信息提供SNP芯片顯示、RNA芯片雙向互動、甲基化芯片分析服務,涵蓋人類和主要模式物種設計能力。豐核信息擁有自主知識產權的標準芯片分析系統(tǒng)品牌,可以快速分析包括Illumina、Agilent更為一致、Affy等公司出品的常規(guī)基因芯片等形式。

 基因芯片

常見芯片列表

 

 

項目分類名稱描述
Illumina SNP芯片Human omni-zhonghua-8 beachip包含90萬個位點
Agilent表達譜芯片Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8×60K V2涵蓋50,599條轉錄本信息
Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8×60K涵蓋55,681條轉錄本信息
Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8×60K涵蓋30,003條Entrez Gene RNAs
Agilent miRNA芯片Agilent Human miRNA Array V19.0覆蓋2006個人類相關miRNA
Agilent Rat miRNA Arrary V19.0覆蓋719個大鼠相關miRNA
Agilent Mouse miRNA Array V19.0覆蓋1247個小鼠相關miRNA
Agilent 定制miRNA Array V19.0可以定制數據庫包含的各個物種的相關miRNA
Illumina人DNA甲基化芯片服務IlluminaInfinium Human Methylation450 BeadChip包含了450,000多個甲基化位

 

 

 

 基因芯片數據分析(以miRNA芯片分析為例)

 

標準分析

芯片預處理與標準化;

篩選差異表達microRNA研究與應用;

microRNA聚類圖飛躍、火山圖以及熱圖等;

microRNA靶基因預測全面協議,基于多數據庫整合的靶基因預測以及上海豐核自主知識產權的預測軟件同時識別重要部署;

對預測的microRNA的靶基因進行GO富集分析通路富集分析等。

 

個性化分析

1.microRNA網絡分析:microRNA靶基因失調網絡工具;microNRA功能協(xié)同作用網絡智慧與合力。

2.microRNA與其他芯片整合分析:與lncRNAs芯片結果聯(lián)合分析(ceRNA Analysis);與mRNA芯片整合分析重要的角色;與DNA甲基化芯片結果聯(lián)合分析開放要求。

3.與臨床數據整合分析

 

 


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