一利用好、miRNA測(cè)序?qū)嶒?yàn)外包服務(wù)介紹
microRNA(miRNA)是一種大小約21—23個(gè)堿基的單鏈小分子RNA,是由具有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的約70-90個(gè)堿基大小的單鏈RNA前體經(jīng)過Dicer酶加工后生成最為顯著,不同于siRNA(雙鏈)但是和siRNA密切相關(guān)尤為突出。microRNA通過和靶基因mRNA堿基配對(duì)引導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的翻譯,從而在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控蛋白表達(dá)(發(fā)現(xiàn)miRNA也能在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因表達(dá))環境。miRNA在物種進(jìn)化中相當(dāng)保守空間載體,在動(dòng)物、植物和真菌等中發(fā)現(xiàn)的miRNA表達(dá)均有嚴(yán)格的組織特異性和時(shí)序性相對簡便。miRNA在細(xì)胞生長和發(fā)育過程中起多種作用重要組成部分,包括調(diào)控發(fā)育、分化表現、凋亡和增殖等特點。
目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR、生物芯片技術(shù)以及第二代測(cè)序技術(shù)結論『椭C共生;诘诙鷾y(cè)序技術(shù)的miRNA測(cè)序,可以一次獲得數(shù)百萬條miRNA序列適應性強,能夠快速鑒定出不同組織技術交流、不同發(fā)育階段、不同疾病狀態(tài)下已知和未知的miRNA及其表達(dá)差異拓展,為研究miRNA對(duì)細(xì)胞進(jìn)程的作用及其生物學(xué)影響提供了有力工具創造更多。
二、miRNA測(cè)序?qū)嶒?yàn)外包服務(wù)分析項(xiàng)目
標(biāo)準(zhǔn)分析項(xiàng)目
1) 原始數(shù)據(jù)質(zhì)控(去接頭污染不斷進步,去低質(zhì)量reads)工藝技術,數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì);
2) 與參考序列比對(duì)規模;
3) 小RNA與rRNA近年來、tRNA、snRNA發展目標奮鬥、snoRNA技術先進、piRNA的比對(duì)信息;
4) 小RNA與miRBase 中范圍的已知的 miRNA的比對(duì)作用;
5) 按照優(yōu)先級(jí)將小RNA進(jìn)行分類注釋情況正常;
6) 預(yù)測(cè)新的miRNA;
7) 差異miRNA分析技術特點;
8) 差異miRNA表達(dá)聚類分析提高鍛煉;
9) miRNA靶基因預(yù)測(cè)分析
10) 靶基因功能富集分析
高級(jí)分析項(xiàng)目(以下分析選擇分析結(jié)果較好的3~5個(gè))
靶基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
miRNA功能協(xié)同網(wǎng)絡(luò)分析
miRNA通路協(xié)同網(wǎng)絡(luò)分析
miRNA共調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
miRNA活性分析
按照客戶要求對(duì)興趣miRNA進(jìn)行深入分析;
重要miRNA的功能富集分析凝聚力量;
三有所提升、miRNA測(cè)序?qū)嶒?yàn)外包服務(wù)樣本要求
RNA樣品總量: ≥3μg
RNA樣品濃度: ≥200 ng/μL
四、miRNA測(cè)序?qū)嶒?yàn)外包服務(wù)項(xiàng)目周期
45個(gè)工作日