在剛果民主共和國(DRC)發(fā)現(xiàn)了第1種廣泛耐藥(XDR)的鼠傷*(一種病原體提供有力支撐，它是撒哈拉以南非洲每年造成數(shù)百萬血流感染的病原體)相對開放。耐藥性已經(jīng)在連續(xù)組增加S.鼠傷寒隨時間勞動精神。這些新菌株對剛果民主共和國的一種常用藥物具有抗藥性明確相關要求，其中一種樣品對這種終抗生素的敏感性降低。
這項研究于今天(2019年9月19日)在Nature Communications上發(fā)表支撐作用，由安特衛(wèi)普熱帶醫(yī)學(xué)研究所(ITM)研學體驗，剛果民主共和國國家研究所(INRB)，威康桑格研究所最為突出，大學(xué)的研究人員進(jìn)行落實落細。劍橋大學(xué)及其合作者自動化。調(diào)查結(jié)果表明，S.鼠傷*已經(jīng)在撒哈拉以南非洲的發(fā)展在過去的幾十年高品質，并繼續(xù)這樣做不折不扣。需要采用多方面的方法來追蹤和控制XDR沙門氏菌的傳播，包括進(jìn)一步的微生物和基因組監(jiān)測資源優勢。
大多數(shù)沙門氏菌感染導(dǎo)致與食物中毒相關(guān)的癥狀高效利用。雖然令人不快，但在絕大多數(shù)病例中癥狀不會危及生命估算。但在撒哈拉以南非洲講理論，沙門氏菌如S.鼠傷*可引起血液，被稱為侵入非傷寒感染沙門氏菌(整數(shù))感染不要畏懼。
每年服務為一體，INTS感染估計影響到340萬人，并導(dǎo)致死亡681316 *逐漸顯現，其中大部分是由引起S.鼠傷*全會精神。在剛果民主共和國等地區(qū)對iNTS感染的控制和治療由于獲得醫(yī)療保健，基礎(chǔ)設(shè)施面臨的挑戰(zhàn)和免疫力下降而變得復(fù)雜更默契了，五歲以下的兒童尤其處于危險之中。
已知的是培訓，在撒哈拉以南非洲的整數(shù)感染是由一種類型的主導(dǎo)S.鼠傷寒稱為ST313不合理波動，其與抗生素抗性相關(guān)。兩組ST313(命名為血統(tǒng)I和II)獨立分裂重要工具，隨后分布在非洲大陸積極拓展新的領域。隨著時間的推移，抗生素耐藥性一直在增長更優質，血管II現(xiàn)在是iNTS感染的主要原因相對開放。
現(xiàn)在，研究伙伴關(guān)系正在努力了解沙門氏菌ST313如何繼續(xù)發(fā)展和發(fā)展耐藥性脫穎而出。對收集到的來自剛果(金)人民醫(yī)院疑似血流感染的血液樣本的工作拓展應用，從INRB和ITM研究人員觀察到的抗生素抗性水平從未見過S.鼠傷*引起血流感染，包括對抗生素*抗性-通常在儲備中持有的藥物案例其他證明無效**結構。
為了更好地理解這些發(fā)現(xiàn)管理，這些菌株進(jìn)行了基因組測序和分析，包括ITM和Wellcome Sanger研究所的生物信息學(xué)分析和實驗室實驗能力建設，以及基因組病原體監(jiān)測中心(CGPS)的機(jī)器學(xué)習(xí)分析模樣。這些分析S.鼠傷*基因組確定了從ST313分支的新亞集團(tuán)，命名譜系II.1表現明顯更佳。據(jù)估計狀態，這一新組織于2004年出現(xiàn)技術節能，具有廣泛的耐藥性(XDR)。
來自Wellcome Sanger研究所的熱帶醫(yī)學(xué)研究所和訪問科學(xué)家的研究的第1作者Sandra Van Puyvelde博士說：“所有抗生素抗性基因都有助于'XDR'存在于同一質(zhì)粒上廣泛認同。這令人擔(dān)憂國際要求，因為質(zhì)粒是一種可以轉(zhuǎn)移到其他細(xì)菌的移動遺傳因素。在積累更多的抗生素抗性的同時共同努力，我們發(fā)現(xiàn)新的鼠傷*系也顯示出進(jìn)一步的遺傳和行為變化行業內卷，這表明細(xì)菌正在進(jìn)化為血流感染。
研究人員還研究了路S.鼠傷*是適應(yīng)侵入性“生活方式”逐漸完善，從形式移開沙門氏菌引起對導(dǎo)致撒哈拉以南非洲的危險侵入血流感染的各類腸胃疾病參與能力。除實驗室實驗外，還使用機(jī)器學(xué)習(xí)算法對樣本進(jìn)行測試是目前主流，該算法旨在尋找沙門氏菌DNA中的特征模式充分發揮，以指示可能導(dǎo)致危險的侵入性感染。
位于Wellcome Sanger研究所的基因組病原體監(jiān)測中心的生物信息學(xué)家Nicole Wheeler博士說：“在實驗室中充分發揮，我們觀察到我們在其他侵入性沙門氏菌中看到的這一新的鼠傷*的變化選擇適用。什么是作為生物信息學(xué)家，有趣的是我們已經(jīng)能夠使用機(jī)器學(xué)習(xí)來獲取這些變化設計。希望在不久的將來業務指導，我們將能夠以更具預(yù)測性的角色部署機(jī)器學(xué)習(xí)，以幫助控制機(jī)器學(xué)習(xí)的出現(xiàn)和傳播就此掀開。細(xì)菌的耐藥菌株如S.鼠傷*“長足發展。
INRB和ITM已經(jīng)在過去的十年里它一直是舉足輕重的在早期發(fā)現(xiàn)的XDR建立血液感染監(jiān)測S.鼠傷*。
剛果民主共和國INRB的Octavie Lunguya教授說：“在我們的血液感染監(jiān)測活動中穩步前行，我們從剛果民主共和國醫(yī)院的患者中分離出鼠傷*〗Y構不合理，F(xiàn)在，我們必須密切監(jiān)測細(xì)菌及其進(jìn)展逐步改善。”
來自劍橋大學(xué)的Gordon Dougan教授說：“這樣的研究是獨1無2的意見征詢，因為我們正在通過深入的生物學(xué)研究在世界各地醫(yī)院觀察到的重要的健康問題之間架起橋梁，我們應(yīng)用技術(shù)大大提高。像這樣的合作是關(guān)鍵的必然要求，將來對于了解新出現(xiàn)的疾病將是非常重要的。“
