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無細(xì)胞DNA檢測病原體并量化損傷

時間:2019-9-16閱讀:194
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  紐約ITHACA - 診斷傳染病的一個常見問題是認為,體內(nèi)存在潛在的病原體并不一定意味著患者生病。這對于器官yi植受者的治療尤其具有挑戰(zhàn)性可持續,因?yàn)槠鞴賧i植受者經(jīng)常與感染以及與免疫抑制相關(guān)的并發(fā)癥進(jìn)行治療全方位。
 
  8月26日發(fā)表在美國國家*院刊上的一項(xiàng)新的康奈爾研究“無細(xì)胞DNA宏基因組序列測定,將宿主損傷反應(yīng)與感染相結(jié)合”系統性,提出了一種識別人體內(nèi)病毒和細(xì)菌的技術(shù)勇探新路。通過使用稱為無細(xì)胞DNA的死亡DNA片段(在整個血液和尿液中漫游)來量化器官損傷。
 
  由此產(chǎn)生的測試簡單傳遞,快速試驗,成本低,并且足以識別數(shù)以千計的細(xì)菌和病毒開展攻關合作。
 
  “這真的是通過與臨床醫(yī)生的合作實(shí)現(xiàn)的製度保障,他們向我們解釋了這一傳染病診斷中的常見問題,”共同*作者Iwijn De Vlaminck說的有效手段,他是Meinig生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院生命科學(xué)與技術(shù)助理教授Robert N. Noyce 統籌推進。“因此,我們開發(fā)了一種檢測方法關鍵技術,可同時告知我們各種病原體的存在與否了解情況,但同時也會告訴我們不同宿主組織的損傷情況。綜合信息使我們能夠更明確地說明一個人是否正在處理疾病技術研究。“
 
  De Vlaminck和他的團(tuán)隊與Weill Cornell Medicine的研究人員合作重要的,專注于腎移植患者的尿路感染。
 
  主要作者和博士學(xué)生Alex Cheng使用高通量DNA測序來鑒定臨床樣品中存在的任何微生物姿勢,并通過亞硫酸氫鹽測序?qū)⑵渑c宿主DNA區(qū)分開來相互融合,這是一個用鹽處理無細(xì)胞DNA以揭示甲基化標(biāo)記的過程。這些標(biāo)記幫助研究人員追蹤無細(xì)胞DNA的起源組織并測量對不同宿主組織的損傷程度綠色化。
 
  “在現(xiàn)場不同需求,試圖診斷傳染病的醫(yī)生和經(jīng)營微生物實(shí)驗(yàn)室的人對使用基因組醫(yī)學(xué)方法進(jìn)行診斷越來越感到興奮,”De Vlaminck說保持穩定。“但是總之,評估該生物體是否真正導(dǎo)致疾病仍然存在很大差距。
 
  “這真的是一個關(guān)鍵問題支撐作用,”他說研學體驗。“因?yàn)橛行┥镏皇枪采w,它們與宿主并存規模。我們的內(nèi)臟充滿了微生物近年來,但這些微生物可能不是你患病的原因講道理。在某種程度上,你被感染了技術先進。你'重新殖民落地生根,但這只是正常生物學(xué)的一部分。“
 
  該測試是如此普遍健康發展,以至于幾乎任何具有DNA基因組的生物都可以被鑒定出來有效保障。
 
  “傳染病是疾病負(fù)擔(dān)的主要原因,”程說長效機製。“它們幾乎影響到每一個人群講實踐,并且它們不是很容易理解。因此奮戰不懈,進(jìn)行一項(xiàng)可以幫助這一大量和廣泛人群的測試令人興奮市場開拓。”
 
  “移植受者,因?yàn)樾枰K身藥物治療來保護(hù)他們的移植器官大大縮短,因此一直存在感染相關(guān)并發(fā)癥的風(fēng)險要落實好,”共同作者,腎臟病更默契了,高血壓和移植醫(yī)學(xué)主任Manidkam Suthanthiran博士和Stanton Griffis Ditinguished教授說先進技術。在Weill Cornell Medicine和NewYork-Presbyterian / Weill Cornell醫(yī)療中心的醫(yī)學(xué)。“一項(xiàng)的測試不僅可以告知感染因子的存在不合理波動,還可以告知是否存在組織損傷宣講手段,這是個性化治療和使器官yi植更安全的重要一步。”
 
  對于共同*作者Darshana Dadhania博士積極拓展新的領域,Weill Cornell Medicine醫(yī)學(xué)副教授和NewYork-Presbyterian / Weill Cornell醫(yī)學(xué)中心的腎臟病專家配套設備,該測試特別有助于診斷BK多瘤病毒(BKV)感染引起的損傷。Dadhania說多種方式,雖然25%至30%的腎移植受者的血液或尿液中含有病毒對外開放,但只有5%的人患有腎病或腎病技術創新。
 
  “在這次調(diào)查中深入交流研討,我們能夠證明,與單獨(dú)使用BKV復(fù)制的人和沒有BKV復(fù)制的人相比廣泛應用,BKV腎病患者的腎臟特異性無尿細(xì)胞DNA更高關註度,這表明該檢測方法可用于監(jiān)測面對活躍的病毒復(fù)制和感染,腎臟受損哪些領域,“Dadhania說敢於挑戰。“這一點(diǎn)特別重要,因?yàn)閷τ诨钴S的BKV復(fù)制沒有特定的治療方法建立和完善。”

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