蛋白純化系統(tǒng)中親和純化常見問題如何解決動力?
1. 鎳柱使用中出現(xiàn)棕色是怎么回事?
出現(xiàn)這樣的情況,主要是緩沖液中 DTT 的影響互動式宣講, DTT 會對鎳柱的顏色和純化效率有很大的影響效高性,在堿性的緩沖液條件下鎳離子會被 DTT 還原生成
棕色的沉淀,所以所有鎳柱的生產(chǎn)商都強調(diào)要盡量避免 DTT 的參與(一般的鎳柱耐受小于 5mM DTT,推薦緩沖液中不要超過2mM DTT)自動化。
2. 通過 His 標(biāo)簽純化的蛋白提升,雜帶比較多,如何改進不折不扣?
(1)如果蛋白純化的是上清支撐能力,蛋白酶會部分降解目的蛋白,可通過加多種蛋白酶控制劑改進高效利用。
(2)可提高雜蛋白與鎳柱結(jié)合起始咪唑濃度特征更加明顯,以降低雜蛋白與鎳柱的親和力。
(3)雜蛋白和目的蛋白結(jié)合講理論,可通過超聲前加入去垢劑的方式消除(1%-2%Tritonx-100)方便。
3. 鎳柱堵了怎么辦?
(1)柱子發(fā)生堵塞各領域,可能是樣品中細胞碎片或其他雜顆粒所致應用領域,所以樣品一定要高速離心保持競爭優勢。
(2)上清純化時,蛋白發(fā)生變性發展機遇,有絮狀物產(chǎn)生長效機製,趕緊加入 1-2mM DTT (上清樣品處理要在冰浴中進行),還不行加尿素變性全技術方案,使其在變形環(huán)境下分享。
(3)樣品處理時的料液比不要太小,否則黏度大分析,或者導(dǎo)致蛋白析出或變性表示,料液比要在1/10-1/15 之間較適宜。
4. 純化過程中非常激烈,蛋白出現(xiàn)了渾濁競爭力所在,怎么辦?
(1)出現(xiàn)渾濁領域,說明蛋白處在不穩(wěn)定的環(huán)境中或者自身就不穩(wěn)定溝通機製,所以要檢查緩沖體系是否正確,環(huán)境是否低溫,或在緩沖液中加入還原劑 DTT自然條件。
(2)加入肌氨酸鈉取得明顯成效,迅速使蛋白變性,消除渾濁現(xiàn)象戰略布局。
5. 如何處理樣品,可使其初步提純(如何洗去蛋白的自身帶)表現明顯更佳?
(1)上清樣品處理狀態,要加入去污劑,蛋白酶控制劑指導,還原劑廣泛認同,還要注意溫度及超聲破碎的參數(shù)。
(2)去大腸桿菌自身帶(兩條 30KD-40KD)可用非變性緩沖液超聲懸噶鲃有?。尤肴ス竸╁懺?,離心 6000r/min,30min,10℃。(若效果不夠可繼續(xù)上述步驟)具體而言。
(3)大腸桿菌包涵體的洗滌工具,可用包涵體洗液多洗幾遍,也可用 1M/2M/4M/8M 尿素逐步溶解喜愛,可選取其中純度較佳的廣泛關註。
(4)可用硫酸銨沉淀法,初步提純。
6. 蛋白掛在柱子上洗脫不下來,怎么解決優勢領先?
(1)洗脫條件太溫和(組氨酸標(biāo)記的蛋白質(zhì)仍然結(jié)合在柱上迎來新的篇章,結(jié)合力較強) 策略:用增加咪唑的梯度洗脫或降低 pH 來找出較佳的洗脫條件。
(2)降低 PH 的方法洗脫的,因 為若 PH 低于 3.5,會導(dǎo)致鎳離子脫落 策略:改變洗脫辦法,咪唑競爭性洗脫
(3)蛋白已沉淀在柱上 策略:減少上樣量和孵育的時間推動並實現,試用去污劑(1%-2%Tritonx-100)或改變 NaCl 的濃度薄弱點,或在變性條件下洗脫(用 8M 脲,或 6M 鹽酸胍)優化程度,也可在洗脫 Buffer中加入 2mMDTT 或者 0.5%肌氨酸鈉進行洗脫積極性。
(4)非特異性疏水或其他相互反應(yīng) 策略:加非離子去污劑到洗脫緩沖液(如,2%Triton X-100)或增加 NaCl 的濃度不斷豐富。
7. 沒能純化到帶 His 標(biāo)簽的蛋白實施體系,蛋白都流穿了(未掛柱)?
(1)超聲的功率不對(太大各有優勢,蛋白炭化效果較好,太小,蛋白沒有釋放) 持續;
策略:改變超聲功率等多個領域,并在超聲前加入溶菌酶。
(2)樣品或者是結(jié)合緩沖液不正確 產品和服務;
策略:檢測 pH 及樣品和結(jié)合緩沖液的組成份(EDTA)應用擴展。
(3)組氨酸的標(biāo)簽沒有*的暴露 ;
策略:在變性條件下(用 8M 脲增多,6M 鹽酸胍,1%SDS) 并加入 1-2mMDTT 進行純化活動上。
(4)His 標(biāo)簽丟失;
策略 1:WB 或者 anti-his 的抗體檢查 His 是否表達進一步推進,上游構(gòu)建導向作用,改變his-tag 的位(C-terminal or N-terminal),必要時增加 his 個數(shù)(常用 6-10 個)示範推廣;
策略 2:孵育的時間不夠處理方法,降低流速和增加孵育的時間重要作用;
策略 3:改變螯合的金屬離子持續向好,尋找到較佳的結(jié)合金屬離子。
Ni2+通常是從宿主細胞蛋白中純化大多數(shù)(組氨酸)6 標(biāo)記的重組蛋白質(zhì)的金屬離子充足,也是一般常用的離子進展情況。蛋白和金屬離子之間的結(jié)合強度受幾種因素影響,包括長度綠色化發展、位置至關重要、親和標(biāo)記在蛋白的暴露程度、所用離子的類型、以及緩沖液的 pH提升行動,因此一些蛋白用其他離子可能更容易地進行純化而不用 Ni2+能力建設。可以利用 Hitrap IMACHP 來篩選不同的金屬離子研究進展。
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