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島津MALDI-TOF微生物鑒定系統(tǒng)探索地下水質(zhì)量和菌群之間的聯(lián)系
地下水中的細菌群落非常重要切實把製度，因為它們保持了平衡的生物地球化學(xué)環(huán)境保供。研究當遭受壓力環(huán)境(例如，由于人為污染)時進行部署，細菌群落及其動態(tài)變化引領。通過面對環(huán)境變化的地下水微生物組的反應(yīng)，可以增加我們對微生物生態(tài)學(xué)不斷增長的了解示範，并將其用于新型生物修復(fù)策略的發(fā)展應用前景。
采用高通量且更簡單的技術(shù)來實時研究不同的微生物群落及其動力學(xué)是必要的，尤其是在檢查較大的數(shù)據(jù)集時運行好。MALDI-TOF是用于高通量鑒定細菌的主要工具首次。美國德克薩斯大學(xué)阿靈頓分校化學(xué)與生物化學(xué)系部署安排、環(huán)境分析與修復(fù)合作實驗室附屬機構(gòu)搖籃，以及圣安東尼奧市和休斯敦UTHealth公共衛(wèi)生學(xué)院基于島津微生物鑒定平臺iDplus Cofidence共同研究探索了油氣開采活動與附近地下水細菌群落之間的聯(lián)系。
MALDI-TOF鑒定受污染地下水中的細菌種類
從德克薩斯州弗里奧縣Eagle Ford頁巖地區(qū)的水樣中發(fā)現(xiàn)的細菌種類的總菌落形成單位(CFU)推廣開來。并顯示了附近活動的常規(guī)生產(chǎn)井(綠點)和非常規(guī)生產(chǎn)井(紫色點)的位置推動。
熱圖：顯示德克薩斯州弗里奧縣的19個地下水樣品中的不同細菌種類。熱圖上的數(shù)字表示CFU資源配置。
在這項工作中信息，從德克薩斯州南部地區(qū)收集了地下水樣品，其中農(nóng)業(yè)活動和非常規(guī)油氣開發(fā)是普遍的人為活動大力發展。使用MALDI-TOF MS對細菌群落進行了評估豐富內涵，并根據(jù)多種有機和無機地下水成分對細菌的多樣性和豐度進行了分析，主要分離了Phylum變形桿菌的反硝化細菌和異養(yǎng)細菌不同需求，這些微生物能夠?qū)⑾跛猁}轉(zhuǎn)化為氣態(tài)形式的氮或降解有機化合物發展，例如碳氫化合物】傊?？傮w而言面向，從所收集的地下水樣品中觀察到的組成差異，細菌群落差異很大研學體驗。這些數(shù)據(jù)為位于人為地表和地下活動附近的地下水中細菌多樣性提供了基線測量建設項目。
參考文獻：
Science of the Total Environment 618 (2018) 165–173
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