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化學(xué)交聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)突破蛋白質(zhì)研究有新方法

2020-08-21 13:29:59來源：儀器網(wǎng)關(guān)鍵詞：質(zhì)譜閱讀量：5721

　　【儀器網(wǎng) 生物醫(yī)藥】蛋白質(zhì)是生命的物質(zhì)基礎(chǔ)，是所有細(xì)胞的主要組成成分哪些領域。蛋白質(zhì)在人體生命活動中占據(jù)主導(dǎo)地位敢於挑戰，新陳代謝、肌肉運(yùn)動建立和完善、氧氣和二氧化碳的運(yùn)輸讓人糾結、免疫反應(yīng)等支持生命存在的基本功能都需要依靠蛋白質(zhì)來實(shí)現(xiàn)。因此對于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和動態(tài)的研究是生命科學(xué)與醫(yī)學(xué)的重要部分穩定發展，對于了解生命的本質(zhì)基石之一、疾病的機(jī)制和治療等都有重要意義。

　　蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和動態(tài)學(xué)研究的方法有很多增持能力，包括冷凍電鏡共同努力、X射線晶體衍射、固體/液體核磁共振追求卓越、分子動力學(xué)模擬等逐漸完善。化學(xué)交聯(lián)質(zhì)譜分析(CXMS)是近十年發(fā)展出的新型蛋白質(zhì)研究技術(shù)。它利用化學(xué)交聯(lián)劑處理蛋白質(zhì)樣品覆蓋，將空間距離足夠接近、可以與交聯(lián)劑反應(yīng)的兩個氨基酸以共價鍵連接起來研究，然后利用基于高精度質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)手段分析交聯(lián)產(chǎn)物高效，可獲得蛋白質(zhì)上特定氨基酸之間的距離信息√岣?；瘜W(xué)交聯(lián)質(zhì)譜分析將質(zhì)譜分析方法的研究對象從多肽序列結(jié)構(gòu)擴(kuò)展到了大分子蛋白結(jié)構(gòu)機構，由于具有靈敏度高，不受分子量大小限制等特點(diǎn)交流，已經(jīng)得到愈加廣泛的使用基礎。

　　在CXMS測量中提供堅實支撐，為了發(fā)生交聯(lián)反應(yīng)，兩個反應(yīng)性蛋白質(zhì)殘基之間的間隔必須短于交聯(lián)劑的長度高產。長的交聯(lián)劑可以達(dá)到更多的反應(yīng)性殘基并提供更多的CXMS距離約束信息化技術，但所得的交聯(lián)劑通常因?yàn)樘L而無法產(chǎn)生有用的結(jié)構(gòu)信息。對于CXMS測量的傳統(tǒng)對象蛋白質(zhì)的Cα原子或Cβ原子來說良好，化學(xué)交聯(lián)通常超過20Å逐步顯現，但是引入這種長距離約束對結(jié)構(gòu)精度的提升有限。

　　針對這一問題引領，中國科學(xué)院精密測量科學(xué)與技術(shù)創(chuàng)新研究院副研究員龔洲自動化裝置、研究員唐淳對已有CXMS實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行比對分析，借鑒生物磁共振思路應用前景，將交聯(lián)劑修飾的側(cè)鏈Cω原子作為距離約束點(diǎn)有很大提升空間。這種方法考慮了蛋白質(zhì)側(cè)鏈的靈活性，并將約束范圍縮小到6Å以內(nèi)激發創作，提高了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)計算的精度前景，并可分析表征蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的動態(tài)變化。相關(guān)成果發(fā)表在Structure上提升。

　　質(zhì)譜技術(shù)在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和動態(tài)研究的應(yīng)用是以電鏡和晶體學(xué)研究方式已經(jīng)無法滿足結(jié)構(gòu)生物學(xué)對體型越來越大大大提高、種類越來越多的蛋白質(zhì)復(fù)合體的研究需要為背景的。CXMS可以提供蛋白質(zhì)柔性區(qū)域的結(jié)構(gòu)研究成果，與冷凍電鏡的數(shù)據(jù)相匹配可以獲得更完整的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)取得了一定進展。新的研究成果為CXMS的發(fā)展提供了新的方向。冷凍電鏡已經(jīng)實(shí)現(xiàn)巨大突破大面積，CXMS的技術(shù)進(jìn)步無疑將使結(jié)構(gòu)生物學(xué)更進(jìn)一步積極參與。

　　資料來源：中科院、生物谷

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