氣相色譜儀柱溫低有利于分配，有利于組分的分離奮勇向前；但柱溫過低不斷豐富，被測組分可能在柱中冷凝，或者傳質(zhì)阻力增加組建，使色譜峰擴張各有優勢，甚至拖尾。柱溫高顯著，雖有利于傳質(zhì)快速增長，但分配系數(shù)變小不利于分離與時俱進。一般通過實驗選擇*柱溫。原則是：使物質(zhì)既分離*初步建立，又不使峰形擴張綜合運用、拖尾。柱溫一般選各組分沸點平均溫度或稍低些的方法。
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