單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)起始核酸材料極少，步驟比普通NGS繁雜體系，實(shí)驗(yàn)周期更長(zhǎng)保障性，難度和風(fēng)險(xiǎn)也更大。重現(xiàn)性和成功率是一大考驗(yàn)責任製。單細(xì)胞測(cè)序方法眾多十分落實，除了商品化試劑盒，許多研究人員也會(huì)針對(duì)自己關(guān)注的特征開(kāi)發(fā)全新的技術(shù)規則製定。另一方面製造業，開(kāi)展腫瘤異質(zhì)性等針對(duì)細(xì)胞群體的研究越來(lái)越普遍，這需要對(duì)大批量細(xì)胞進(jìn)行逐一的測(cè)序和解析關規定。如果按照試劑盒常量/rxn發展基礎，手工完成每一個(gè)細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)，勞力和成本都難以承受迎難而上。
Echo硬核的聲波移液技術(shù)技術(shù)積極，通過(guò)能量控制準(zhǔn)確的納升級(jí)液體轉(zhuǎn)移，噴射液滴單位可以低至2.5 nL。其非物理接觸產業、準(zhǔn)確小量移液滿意度、高速度的特征，決定了Echo非常適合解決單細(xì)胞測(cè)序中遇到的超高通量可持續、技術(shù)靈活多變主要抓手、反應(yīng)scale-down成本控制、交叉污染等問(wèn)題全過程。
非物理接觸
· 樣本完整性
· 無(wú)吸頭消耗
· 降低交叉污染風(fēng)險(xiǎn)
移液的靈活性
· 2.5 /25 nL 每滴
· 200-500 滴/秒
· 任意孔至任意孔移液
移液條件溫和
· DNA/RNA/蛋白等生物大分子
以結(jié)合SMART-Seq cDNA文庫(kù)制備及Nextera XT 測(cè)序文庫(kù)制備的單細(xì)胞RNA-seq實(shí)驗(yàn)為例集成應用。SMART-Seq反應(yīng)體系(50 uL)可以由Echo縮小4，5不負眾望，8高效流通，10，16精準調控，20至32倍功能，Nextera XT 試劑盒可縮小10倍(50 uL至5 ul)使用。值得注意的是解決，SMART-seq cDNA文庫(kù)制備中預期，常量反應(yīng)總體積為50 ul, 縮小32倍后反應(yīng)總體積僅僅只有1.75 uL，還不及一個(gè)常量反應(yīng)中逆轉(zhuǎn)錄酶使用量大幅度。借助Echo結構，一個(gè)96 rxn的試劑盒將具備完成3072 rxn的可能。
Echo可以完成
● 微量化的單細(xì)胞基因組放大3
● 微量化的單細(xì)胞測(cè)序文庫(kù)制備
● 微量化的文庫(kù)濃度質(zhì)控
● 一步法文庫(kù)Normalization&Pooling
● Better together—— Echo plus Biomek自動(dòng)化單細(xì)胞測(cè)序方案
基于Echo的單細(xì)胞文庫(kù)制備不受待測(cè)細(xì)胞數(shù)目的限制貢獻，支持各種試
Better together—— Echo plus Biomek自動(dòng)化單細(xì)胞測(cè)序方案
基于Echo的單細(xì)胞文庫(kù)制備不受待測(cè)細(xì)胞數(shù)目的限制規模最大，支持各種試劑盒的靈活組合和NGS建庫(kù)方法學(xué)DIY。做你想做的統籌，測(cè)你想測(cè)的最深厚的底氣，提供scale-down的微量化反應(yīng)體系和scale-up的自由度。
將Echo聲波移液工作站與Biomek i-系列自動(dòng)化工作站結(jié)合振奮起來，可實(shí)現(xiàn)更高自動(dòng)化程度的單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)品質。Echo完成文庫(kù)制備中涉及的微量化反應(yīng)體系構(gòu)建， 由Biomek自動(dòng)化工作站配合實(shí)現(xiàn)文庫(kù) Agencourt SPRIselect磁珠PCR clean-up和片段篩選勞動精神。實(shí)驗(yàn)流中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)均可查可溯開展攻關合作，保證文庫(kù)信息安全可靠。
參考：
1. US Patent 6938987
2. US Patent 6938995
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