離子色譜儀其實本質(zhì)上是液相色譜的分支大大縮短，但是由于其分離的是陰陽離子和極性物質(zhì)，其檢測器也以電導(dǎo)檢測器為主更高要求，與高效液相色譜主要用于分離有機物越來越重要的位置、使用紫外可見吸收檢測器有很大的區(qū)別，因此逐漸從液相色譜中分離出來共同學習，獨立為色譜方法中的一個分支順滑地配合。離子色譜與高效液相色譜的差異主要體現(xiàn)在儀器結(jié)構(gòu)和應(yīng)用范圍兩個方面。
1）離子色譜與高效液相色譜在儀器結(jié)構(gòu)方面的差異
兩者均有溶劑輸送系統(tǒng)效高、進樣系統(tǒng)前沿技術、檢測系統(tǒng)和信號記錄和處理系統(tǒng)，但由于離子色譜和高效液相色譜所用的流動相不同性能，因而檢測方式及信號處理也不同多種方式，在各部件上有一些差別對外開放。
A、離子色譜一般采用酸深入交流研討、堿及鹽的水溶液作為流動相資料，要求系統(tǒng)可以耐酸、耐堿關註度，因此通常離子色譜裝置采用非金屬材質(zhì)橫向協同。例如：采用聚醚醚酮（PEEK）塑料作為泵體、流路和閥體等要求耐高壓的部分敢於挑戰，而以聚四氟乙烯或PEEK材料作為檢測器不斷創新，外接管路等。由于加工和強度方面的差異提供了遵循，一般情況下全塑的材料在耐壓強度和精度上比金屬材料要略低一些參與水平。
高效液相色譜一般采用有機溶劑作淋洗液，因此多數(shù)采用金屬泵體基石之一，可以耐任何類型的有機溶劑聯動，但對于酸或堿性流動相，易產(chǎn)生腐蝕現(xiàn)象模樣。隨著高效液相色譜在生物領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用生產體系，為了避免金屬對一些生物活性物質(zhì)的吸附作用，一些在生物方面應(yīng)用的高效液相色譜儀器也采用PEEK材料作為泵體很重要、流路和閥能力和水平。在這一領(lǐng)域，離子色譜和高效液相色譜具有了一定的通用性異常狀況。
B研究、離子色譜可分為抑制型和非抑制型，采用抑制器的抑制型離子色譜目前應(yīng)用廣泛應用創新。高效液相色譜沒有類似的裝置提高。抑制器在結(jié)構(gòu)上與高效液相色譜的柱后衍生系統(tǒng)相似，但抑制器是抑制型離子色譜常備組件之一的特性。非抑制型離子色譜不用抑制器交流，與高效液相色譜十分相似，一些非抑制型離子色譜有時可以采用高效液相色譜的泵提供堅實支撐、流路和進樣閥還不大。
C、檢測器是離子色譜與高效液相色譜的又一主要差別信息化技術。高效液相色譜常采用紫外-可見光度檢測器發揮作用；而離子色譜通用的是電導(dǎo)檢測器。
2）離子色譜與高效液相色譜的分析對象差別很大
高效液相色譜作為分析儀器中廣泛使用的一類儀器，在許多領(lǐng)域中被廣泛應(yīng)用銘記囑托。采用高效液相色譜時引領，常要求被測物具有一定光度吸收，因此高效液相色譜一般可以用于有機化合物的分析示範。而離子色譜主要利用離子在水溶液中電離產(chǎn)生電導(dǎo)的特點應用前景，因而主要用于無機離子的分析。
當(dāng)然運行好，離子色譜和高效液相色譜的應(yīng)用并不是沒有交叉預下達，目前離子色譜已經(jīng)廣泛用于有機化合物的分析，而高效液相色譜也可以解決大量無機離子的分析問題統籌推進，兩種分離模式具有一定的互補性。一些高效液相色譜無法解決的分析難題大大提高，可以嘗試用離子色譜的方法來解決的必然要求。
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