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宏基因組測序?qū)嶒?yàn)外包服務(wù)

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一有效保障、宏基因組測序?qū)嶒?yàn)外包服務(wù)介紹

宏基因組學(xué)研究不要求對每個微生物進(jìn)行分離純化培養(yǎng)大數據,而是直接從樣品中提取基因組DNA后進(jìn)行測序分析。通過宏基因組測序進一步提升,能夠解釋微生物群落多樣性空間廣闊、種群結(jié)構(gòu)、進(jìn)化關(guān)系改革創新、功能活性及環(huán)境之間的相互協(xié)作關(guān)系完成的事情,*地?cái)U(kuò)展了微生物學(xué)研究范圍大大提高。環(huán)境微生物多樣性檢測是指通過對環(huán)境中微生物16S rDNA高變區(qū)/ITS 的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行高通量測序戰略布局,分析該環(huán)境下微生物群落的多樣性和分布規(guī)律創新的技術。

 

二、宏基因組測序?qū)嶒?yàn)外包服務(wù)分析項(xiàng)目

標(biāo)準(zhǔn)分析項(xiàng)目

1. 去除宿主污染組織了,產(chǎn)出數(shù)據(jù)及質(zhì)控統(tǒng)計(jì)

2. 組裝前的可能性,通過K-mer分析評估樣品的測序深度

3. 序列組裝

4. 基因組結(jié)構(gòu)注釋(串聯(lián)重復(fù)序列注釋、短回文重復(fù)序列注釋服務為一體、可變遺傳因子注釋問題、基因編碼區(qū)域預(yù)測、NCBI NR庫比對全會精神、致病島預(yù)測系統穩定性、前噬菌體預(yù)測、毒力因子預(yù)測集中展示,可選)

5.基因功能注釋(GO功能注釋實力增強,KEGG通路注釋,Swissprot數(shù)據(jù)庫注釋探索創新、COG功能分類)

6.比較基因組分析(基因家族分析帶來全新智能,系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建,物種分期時間預(yù)測)

7. 生物種類和豐度估計(jì)

8. 樣本間群落結(jié)構(gòu)比較(多樣本)新產品;

9. 微生物生物分布與環(huán)境關(guān)聯(lián)分析(多樣本)去完善;

宏基因組測序?qū)嶒?yàn)外包服務(wù)

高級分析項(xiàng)目

重要結(jié)論的獲得;

聚類分析;

主成分分析長遠所需;

通路富集分析求索;

功能富集分析;

個性化分析


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